Село Пирогівка розташоване на лівому низькому березі річки Десни. На північній околиці села в Десну впадає притока – річка Шостка, яка утворює невеликий мис. Десна тут дуже сильно звивається, роблячи багато меандрів, стариць та заболочених озер. Весню під час танення снігів вся ця низинна територія затоплюєтьсь водою. З давніх давен тут селилися люди. В цих місцях були знайдені поселення часів неоліту та Юхнівської культури. В середні віки поблизу села Пирогівка існував перевіз через Десну. Через цю місцину на початку 18 століття проходили війська Петра І та Івана Мазепи з Карлом ХІІ. В середині 18 століття в Пирогівці вихідцями з Наддніпрянщини була побудована дерев’яна козацька церква, без жодного цвяху. Побудована у 1777 році за кошти місцевого поміщика М. Холодовського. Розташовується на рівнині в центрі села. Споруда проглядається з багатьох сторін і є архітектурною домінантою в селі. Церква п’ятизрубна, одноверха. Виглядає дуже тендітно і стримано. В 19 столітті до церкви прибудували дзвіницю. В ті часи це був типовий зразок сільського храму, але зараз таких церков залишилися одиниці – та ще й в цій місцевості.
